​【课题反套路】生了个白眼狼--做腻了ceRNA和RBP思路？来看看circRNA新机制

Hello！大家好！我是喜欢给大家推荐科研套路的胖师兄。

近来接到大家反馈：胖师兄，能不能来点新东西；天天看见非编码就是ceRNA套路和RBP套路，你是不是就知道这两种非编码研究思路？（what？质疑我的专业性？燚大）

所以，从今天开始胖师兄要来展示真正的技术了，来给大家反一反套路，提供一些研究新思路（做的人多了，最终还是变回套路；这可能就是长大了渐渐变成自己最讨厌的样子吧）。

废话不多说，开整。

今天推荐大家的一篇思路新奇的发表在molecular cancer（曾经的套路大刊，感觉今年上了15分之后渐渐发了一些匹配IF的文章了）名为“CircRNA inhibits DNA damage repair by interacting with host gene”的文章。

首先从题目和摘要我们就可以得知这个机制不属于ceRNA和RBP了，而是circRNA和其本身的宿主基因（就是这个circRNA的亲本基因）互作形成R-loop进而干预其线性的亲本基因外显子转录暂停，最后就导致亲本基因的表达下调（不肖子孙啊）。 

来一起看看他的整体研究思路是什么样的吧：

第一步：找乳腺癌当中最不孝的circRNA

用六个患者的（也不多啊）癌、癌旁和外周血这三种临床组织去筛差异circRNA，根据circRNA/线性宿主基因这样一个比值发现外周血中平均比值最高，远高于癌和癌旁组织；基于开发新的诊断标志物考虑从外周血中挑了六个比值最高的circRNA（最不孝的六个仔）进一步鉴定不孝程度，最后找到了最不孝的一个circ SMARCA5（心疼SMARCA5一秒），准备后面对他进行严刑拷打看看他是怎么不孝的。 

第二步：circ SMARCA5不孝的证据采集

体外细胞功能实验证明circ SMARCA5可以下调SMARCA5。

第三步：circ SMARCA5如何不孝的

先证明circ SMARCA5屏蔽15号外显子终止SMARCA5转录，再来证明其促进了一个没有功能的SMARCA5截断体蛋白ΔSMARCA5生成（其实也不一定没功能，大胆猜测一下也许以后这会被发现是个促癌因子呢？）。

第四步：明确具体R-loop结构

确定位点（可以用点突变啥的）、Mfold程序确定一下结构得出结论--这个circRNA和其亲本在XX位点上形成R-loop结构，最后做一下体内外功能验证这个不孝机制可以干预细胞DNA损伤修复这一功能，整个思路就完成了。

最后总结一下整体思路与circRNA研究传统套路的区别：

1.上游机制完全创新，形成R-loop结果进而干预亲本基因转录导致亲本基因所调控的功能不能够正常发挥；

2.没有了，因为这就是个新机制嘛，该做的功能验证、结合预测、结合位点突变等等传统套路的东西不可能完全舍弃；

但是就算这样，有一个新的circRNA调控机制傍身也可以给你的课题设计格调提升很大了！

所以，这个circRNA调控亲本基因转录的新思路拿走不谢！

我是不止会玩套路的胖师兄，下期见！

注：此推文未经许可禁止转载！

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